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acRIP-seq的富集效率是決定數據質(zhì)量的關(guān)鍵,云序生物acRIP-seq實(shí)驗采用預驗證的商業(yè)化抗體和精心優(yōu)化的實(shí)驗流程,具有極高的效率和特異性。
分子全覆蓋
可全 面檢測mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多類(lèi)RNA分子ac4C乙?;稽c(diǎn)。
可整合RNA乙?;瘮祿娃D錄組數據進(jìn)行生物信息學(xué)關(guān)聯(lián)分析,揭示RNA乙?;瘜虮磉_調控的影響,深入挖掘RNA乙?;墓δ?。
案例解析美國ai癥研究所(NCI)和弗雷德里克實(shí)驗室,發(fā)現下調NAT10(RNA乙?;福┠軌蛞?制Hela細胞的行為;并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修飾,下調NAT10后,ac4C的總體水平下降;為了進(jìn)一步探究ac4C的功能,作者對WT和下調NAT10的Hela細胞進(jìn)行acRIP-seq和mRNA測序,發(fā)現ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS區,同時(shí)下調NAT10能夠降低ac4C在mRNA中的定點(diǎn)表達,并與靶mRNA的下調有很大關(guān)系;作者又進(jìn)一步發(fā)現ac4C乙?;揎椖軌蛲ㄟ^(guò)延長(cháng)mRNA的半衰期并促進(jìn)mRNA的穩定性,同時(shí)也能夠通過(guò)ac4C peak中的密碼子偏好性表達,決定并影響mRNA的解碼效率,促進(jìn)底物翻譯。這些發(fā)現不僅擴大了mRNA修飾范圍(包括乙?;瘹埢?,也確立了ac4C在mRNA翻譯調控中的作用。
圖注:ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況
圖注:ac4C延長(cháng)mRNA的半衰期,提高其穩定性
acRIP-seq的富集效率是決定數據質(zhì)量的關(guān)鍵,云序生物acRIP-seq實(shí)驗采用預驗證的商業(yè)化抗體和精心優(yōu)化的實(shí)驗流程,具有極高的效率和特異性。
分子全覆蓋
可全 面檢測mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多類(lèi)RNA分子ac4C乙?;稽c(diǎn)。
可整合RNA乙?;瘮祿娃D錄組數據進(jìn)行生物信息學(xué)關(guān)聯(lián)分析,揭示RNA乙?;瘜虮磉_調控的影響,深入挖掘RNA乙?;墓δ?。
案例解析美國ai癥研究所(NCI)和弗雷德里克實(shí)驗室,發(fā)現下調NAT10(RNA乙?;福┠軌蛞?制Hela細胞的行為;并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修飾,下調NAT10后,ac4C的總體水平下降;為了進(jìn)一步探究ac4C的功能,作者對WT和下調NAT10的Hela細胞進(jìn)行acRIP-seq和mRNA測序,發(fā)現ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS區,同時(shí)下調NAT10能夠降低ac4C在mRNA中的定點(diǎn)表達,并與靶mRNA的下調有很大關(guān)系;作者又進(jìn)一步發(fā)現ac4C乙?;揎椖軌蛲ㄟ^(guò)延長(cháng)mRNA的半衰期并促進(jìn)mRNA的穩定性,同時(shí)也能夠通過(guò)ac4C peak中的密碼子偏好性表達,決定并影響mRNA的解碼效率,促進(jìn)底物翻譯。這些發(fā)現不僅擴大了mRNA修飾范圍(包括乙?;瘹埢?,也確立了ac4C在mRNA翻譯調控中的作用。
圖注:ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況
圖注:ac4C延長(cháng)mRNA的半衰期,提高其穩定性
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