取消
清空記錄
歷史記錄
清空記錄
歷史記錄
技術(shù)簡(jiǎn)介
m7G RNA甲基化是在甲基化轉移酶的作用下,使RNA鳥(niǎo)嘌呤(G)的第七位N上加上甲基的一種修飾( N7-methylguanosine,m7G)。研究表明,m7G RNA甲基化修飾存在于各類(lèi)分子中,包括:mRNA 5’帽子結構、mRNA內部、pri-miRNA、轉運RNA(tRNA)和核糖體RNA(rRNA)。m7G RNA甲基化修飾能夠調節mRNA的轉錄、miRNA的生物合成和生物學(xué)功能、tRNA穩定性、18S rRNA的核內加工及成熟。m7G RNA甲基化修飾作為一類(lèi)新型RNA甲基化,近兩年高影響因子文章不斷,是繼m6A修飾之后的又一表觀(guān)轉錄組學(xué)熱點(diǎn)。
云序生物提供兩種m7G RNA甲基化測序服務(wù):(1)m7G RNA甲基化單堿基測序(AlkAniline-Seq),可對m7G修飾進(jìn)行高通量檢測和單堿基定位;(2)MeRIP測序,可通過(guò)m7G特異性抗體,抓取有甲基化修飾的片段進(jìn)行測序,對m7G修飾進(jìn)行高通量測序和peak峰定位。此外,云序生物針對m7G RNA甲基化開(kāi)發(fā)了多款產(chǎn)品,可實(shí)現對mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多類(lèi)RNA分子的m7G甲基化修飾水平的全 面檢測。
云序優(yōu)勢
單堿基分辨
m7G RNA甲基化單堿基測序方式,可對m7G甲基化修飾進(jìn)行單堿基定位。
抗體富集效率高
m7G MeRIP測序方式,采用預驗證的商業(yè)化抗體和精心優(yōu)化的實(shí)驗流程,具有極高的效率和特異性。
高通量檢測
可對全轉錄組范圍內的m7G位點(diǎn)進(jìn)行高通量地平行檢測。
全分子覆蓋
可全 面地對環(huán)狀RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多類(lèi)RNA分子的m7G位點(diǎn)進(jìn)行檢測。
一站式服務(wù)
客戶(hù)僅需提供組織或細胞,云序生物一站式完成RNA抽提,樣品預處理,建庫,測序,數據分析全套流程。
專(zhuān)業(yè)的生物信息學(xué)分析
專(zhuān)業(yè)的生物信息學(xué)團隊,能夠滿(mǎn)足客戶(hù)的各類(lèi)深入數據分析需求
案例分析
案例1:哺乳動(dòng)物mRNA內m7G甲基化轉錄組圖譜
原文:Transcriptome-wide Mapping of Internal N7-Methylguanosine Methylome in Mammalian mRNA
期刊:Molecular Cell 影響因子:14.25
由于種類(lèi)的反轉錄酶均無(wú)法將RNA m7G位點(diǎn)逆轉錄成對應發(fā)生堿基突變的cDNA,為了準確的探究RNA內m7G甲基化情況,何川團隊利用m7G自帶正電荷的特征,開(kāi)發(fā)了新的m7G單堿基深度測序方法。該方法能夠將RNA內含m7G位點(diǎn)轉化為另一種可產(chǎn)生反轉錄堿基變異的新位點(diǎn),并依據堿基變異率估計m7G位點(diǎn)的甲基化水平。此方法隨后也被證實(shí)可檢測18S rRNA中的1639位內含m7G位點(diǎn)以及可揭示人類(lèi)細胞tRNA中的22個(gè)46位內含m7G位點(diǎn)。并觀(guān)測到其在mRNA分布、富集的共有序列及其它統計特征與m7G-MeRIP-seq數據基本保持一致。該文章不僅揭示了m7G甲基化在人類(lèi)細胞中的分布特征,同時(shí)還發(fā)現METTL1是一種甲基轉移酶,它在mRNA中催化了m7G甲基化修飾,并表明m7G的內部甲基化可以影響mRNA的翻譯。
案例2:METTL1通過(guò)m7G甲基化促進(jìn)let-7 MicroRNA的加工
原文:METTL1 Promotes let-7 MicroRNA Processing via m7G Methylation
期刊:Molecular Cell 影響因子:14.25
劍橋大學(xué)戈登研究所和病理學(xué)系中心,借助m7G RNA甲基化測序技術(shù),識別了A549細胞中miRNA具有m7G甲基化修飾。該研究發(fā)現Mettl1調控的pri-let7 m7G修飾通過(guò)改變pri-let7中G-四重結構,進(jìn)一步調控pre-let7和let7的表達,影響肺ai細胞遷移。該研究揭示了Mettl1依賴(lài)的m7G甲基化修飾可以作為調控miRNA結構、生物發(fā)生和細胞遷移的一種新的RNA修飾。
樣本要求
樣品類(lèi)型
細胞、組織或RNA,其他樣本類(lèi)型請電詢(xún)。
測序樣品量
1.單堿基測序方式:
a) 細胞:≥1×108
b) 組織:500 mg - 5 g
c) RNA:100 μg - 300 μg
2. MeRIP測序方式:
a) 細胞:≥2×107
b) 組織:100mg - 1g
c) RNA:30 μg - 300 μg
d) 超微量滿(mǎn)足500 ng - 30 μg
樣品運輸及保存
樣品運輸:樣品置于1.5mL離心管中,封口膜封好,干冰運輸。
樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊可用TRIZOL或RNA保護劑處理,液氮凍存后-80℃保存;RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存,避免反復凍融。
技術(shù)簡(jiǎn)介
m7G RNA甲基化是在甲基化轉移酶的作用下,使RNA鳥(niǎo)嘌呤(G)的第七位N上加上甲基的一種修飾( N7-methylguanosine,m7G)。研究表明,m7G RNA甲基化修飾存在于各類(lèi)分子中,包括:mRNA 5’帽子結構、mRNA內部、pri-miRNA、轉運RNA(tRNA)和核糖體RNA(rRNA)。m7G RNA甲基化修飾能夠調節mRNA的轉錄、miRNA的生物合成和生物學(xué)功能、tRNA穩定性、18S rRNA的核內加工及成熟。m7G RNA甲基化修飾作為一類(lèi)新型RNA甲基化,近兩年高影響因子文章不斷,是繼m6A修飾之后的又一表觀(guān)轉錄組學(xué)熱點(diǎn)。
云序生物提供兩種m7G RNA甲基化測序服務(wù):(1)m7G RNA甲基化單堿基測序(AlkAniline-Seq),可對m7G修飾進(jìn)行高通量檢測和單堿基定位;(2)MeRIP測序,可通過(guò)m7G特異性抗體,抓取有甲基化修飾的片段進(jìn)行測序,對m7G修飾進(jìn)行高通量測序和peak峰定位。此外,云序生物針對m7G RNA甲基化開(kāi)發(fā)了多款產(chǎn)品,可實(shí)現對mRNA、LncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多類(lèi)RNA分子的m7G甲基化修飾水平的全 面檢測。
云序優(yōu)勢
單堿基分辨
m7G RNA甲基化單堿基測序方式,可對m7G甲基化修飾進(jìn)行單堿基定位。
抗體富集效率高
m7G MeRIP測序方式,采用預驗證的商業(yè)化抗體和精心優(yōu)化的實(shí)驗流程,具有極高的效率和特異性。
高通量檢測
可對全轉錄組范圍內的m7G位點(diǎn)進(jìn)行高通量地平行檢測。
全分子覆蓋
可全 面地對環(huán)狀RNA、mRNA、lncRNA、pri-miRNA、tRNA和rRNA等多類(lèi)RNA分子的m7G位點(diǎn)進(jìn)行檢測。
一站式服務(wù)
客戶(hù)僅需提供組織或細胞,云序生物一站式完成RNA抽提,樣品預處理,建庫,測序,數據分析全套流程。
專(zhuān)業(yè)的生物信息學(xué)分析
專(zhuān)業(yè)的生物信息學(xué)團隊,能夠滿(mǎn)足客戶(hù)的各類(lèi)深入數據分析需求
案例分析
案例1:哺乳動(dòng)物mRNA內m7G甲基化轉錄組圖譜
原文:Transcriptome-wide Mapping of Internal N7-Methylguanosine Methylome in Mammalian mRNA
期刊:Molecular Cell 影響因子:14.25
由于種類(lèi)的反轉錄酶均無(wú)法將RNA m7G位點(diǎn)逆轉錄成對應發(fā)生堿基突變的cDNA,為了準確的探究RNA內m7G甲基化情況,何川團隊利用m7G自帶正電荷的特征,開(kāi)發(fā)了新的m7G單堿基深度測序方法。該方法能夠將RNA內含m7G位點(diǎn)轉化為另一種可產(chǎn)生反轉錄堿基變異的新位點(diǎn),并依據堿基變異率估計m7G位點(diǎn)的甲基化水平。此方法隨后也被證實(shí)可檢測18S rRNA中的1639位內含m7G位點(diǎn)以及可揭示人類(lèi)細胞tRNA中的22個(gè)46位內含m7G位點(diǎn)。并觀(guān)測到其在mRNA分布、富集的共有序列及其它統計特征與m7G-MeRIP-seq數據基本保持一致。該文章不僅揭示了m7G甲基化在人類(lèi)細胞中的分布特征,同時(shí)還發(fā)現METTL1是一種甲基轉移酶,它在mRNA中催化了m7G甲基化修飾,并表明m7G的內部甲基化可以影響mRNA的翻譯。
案例2:METTL1通過(guò)m7G甲基化促進(jìn)let-7 MicroRNA的加工
原文:METTL1 Promotes let-7 MicroRNA Processing via m7G Methylation
期刊:Molecular Cell 影響因子:14.25
劍橋大學(xué)戈登研究所和病理學(xué)系中心,借助m7G RNA甲基化測序技術(shù),識別了A549細胞中miRNA具有m7G甲基化修飾。該研究發(fā)現Mettl1調控的pri-let7 m7G修飾通過(guò)改變pri-let7中G-四重結構,進(jìn)一步調控pre-let7和let7的表達,影響肺ai細胞遷移。該研究揭示了Mettl1依賴(lài)的m7G甲基化修飾可以作為調控miRNA結構、生物發(fā)生和細胞遷移的一種新的RNA修飾。
樣本要求
樣品類(lèi)型
細胞、組織或RNA,其他樣本類(lèi)型請電詢(xún)。
測序樣品量
1.單堿基測序方式:
a) 細胞:≥1×108
b) 組織:500 mg - 5 g
c) RNA:100 μg - 300 μg
2. MeRIP測序方式:
a) 細胞:≥2×107
b) 組織:100mg - 1g
c) RNA:30 μg - 300 μg
d) 超微量滿(mǎn)足500 ng - 30 μg
樣品運輸及保存
樣品運輸:樣品置于1.5mL離心管中,封口膜封好,干冰運輸。
樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊可用TRIZOL或RNA保護劑處理,液氮凍存后-80℃保存;RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存,避免反復凍融。
在線(xiàn)留言
相關(guān)推薦
復制成功
×