<samp id="2i4cn"></samp>
  • <p id="2i4cn"></p>

    <span id="2i4cn"><input id="2i4cn"></input></span>

    <label id="2i4cn"><code id="2i4cn"></code></label>
  • 搜索

    取消

    清空記錄

    歷史記錄

    清空記錄

    歷史記錄

    清空記錄

    歷史記錄

    上海云序生物科技有限公司
    網(wǎng)站標題
    021-64878766
    上海云序生物科技有限公司

    技術(shù)平臺

    聯(lián)系我們


    云序生物

    021-64878766

    market@cloud-seq.com.cn

    上海市松江區莘磚公路518號24號樓4樓

    ac4C LncRNA測序(acRIP-seq)

    分享到微信

    ×
    云序生物對ac4C RNA乙?;瘷z測手段為acRIP-Seq技術(shù),技術(shù)原理如下: 將乙?;疪NA特異性抗體與被隨機打斷的RNA片段進(jìn)行共孵育,抓取有乙?;揎椀钠芜M(jìn)行測序;同時(shí)需要平行測序一個(gè)對照(Input)樣本,對照樣本只含有打斷的RNA片段,并不添加RNA乙?;禺愋钥贵w與其共孵育。
    技術(shù)詳情
    技術(shù)簡(jiǎn)介
    ac4C RNA乙?;窃赗NA ac4C修飾酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶發(fā)生乙?;囊环N保守的化學(xué)修飾(N4-acetylcytidine)。早期研究發(fā)現該修飾存在于真核生物中絲氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,導致Watson-Crick堿基熱穩定性增加,調控蛋白合成中的編碼準確性;近期研究發(fā)現ac4C分布在人類(lèi)轉錄組中,大多數位點(diǎn)出現在編碼序列(CDS)內,并且通過(guò)改善的mRNA穩定性和翻譯促進(jìn)靶基因表達。目前,ac4C RNA乙?;揎椬鳛橐活?lèi)新型RNA修飾,是繼m6A修飾之后的又一表觀(guān)轉錄組學(xué)熱點(diǎn)和“超級潛力股”!
    云序生物對ac4C RNA乙?;瘷z測手段為acRIP-Seq技術(shù),技術(shù)原理如下: 將乙?;疪NA特異性抗體與被隨機打斷的RNA片段進(jìn)行共孵育,抓取有乙?;揎椀钠芜M(jìn)行測序;同時(shí)需要平行測序一個(gè)對照(Input)樣本,對照樣本只含有打斷的RNA片段,并不添加RNA乙?;禺愋钥贵w與其共孵育。對照樣本用于消除非特異性抓取的乙?;蔚谋尘?。對比免疫共沉淀(IP)樣本和對照樣本(Input)中的序列片段,將RNA乙?;揎椢稽c(diǎn)定位到轉錄組上,并根據RNA-seq數據,計算樣本中RNA乙?;潭燃皩NA表達水平的影響。

    云序優(yōu)勢
    一站式服務(wù)
    客戶(hù)只需提供組織、細胞、體液樣品或RNA,云序生物為您完成從ac4C RNA富集,文庫制備,上機測序到數據分析整套服務(wù)流程。
    抗體富集效率高

    acRIP-seq的富集效率是決定數據質(zhì)量的關(guān)鍵,云序生物acRIP-seq實(shí)驗采用預驗證的商業(yè)化抗體和精心優(yōu)化的實(shí)驗流程,具有極高的效率和特異性。

    分子全覆蓋
    可全 面檢測mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多類(lèi)RNA分子ac4C乙?;稽c(diǎn)。

    嚴格的質(zhì)控
    云序生物對acRIP-seq實(shí)驗每一步驟均設有關(guān)鍵質(zhì)控,全程監控實(shí)驗質(zhì)量,保證客戶(hù)得到優(yōu) 質(zhì)數據。
    專(zhuān)業(yè)的生物信息學(xué)分析
    云序生物擁有專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊,幫助客戶(hù)進(jìn)行實(shí)驗數據的全 面挖掘。
    RNA乙?;?/strong>測序與轉錄組聯(lián)合應用

    可整合RNA乙?;瘮祿娃D錄組數據進(jìn)行生物信息學(xué)關(guān)聯(lián)分析,揭示RNA乙?;瘜虮磉_調控的影響,深入挖掘RNA乙?;墓δ?。 

    案例解析
    案例:mRNA中胞嘧啶核苷乙?;龠M(jìn)其翻譯效率
    原文:Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency 
    期刊:Cell      影響因子:36.22 
    美國ai癥研究所(NCI)和弗雷德里克實(shí)驗室,發(fā)現下調NAT10(RNA乙?;福┠軌蛞?制Hela細胞的行為;并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修飾,下調NAT10后,ac4C的總體水平下降;為了進(jìn)一步探究ac4C的功能,作者對WT和下調NAT10的Hela細胞進(jìn)行acRIP-seq和mRNA測序,發(fā)現ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS區,同時(shí)下調NAT10能夠降低ac4C在mRNA中的定點(diǎn)表達,并與靶mRNA的下調有很大關(guān)系;作者又進(jìn)一步發(fā)現ac4C乙?;揎椖軌蛲ㄟ^(guò)延長(cháng)mRNA的半衰期并促進(jìn)mRNA的穩定性,同時(shí)也能夠通過(guò)ac4C peak中的密碼子偏好性表達,決定并影響mRNA的解碼效率,促進(jìn)底物翻譯。這些發(fā)現不僅擴大了mRNA修飾范圍(包括乙?;瘹埢?,也確立了ac4C在mRNA翻譯調控中的作用。
    ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況

    圖注:ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況


    ac4C延長(cháng)mRNA的半衰期,提高其穩定性

    圖注:ac4C延長(cháng)mRNA的半衰期,提高其穩定性


    ac4C促進(jìn)mRNA的翻譯效率
    圖注:ac4C促進(jìn)mRNA的翻譯效率

    樣品要求
    樣品類(lèi)型
    細胞、組織或RNA,其他樣本類(lèi)型請電詢(xún)。
    樣品量
    a)細胞:≥2×107
    b)組織:500mg - 1g
    c)  RNA:30μg - 300μg 
    d) 超微量滿(mǎn)足500ng - 30μg

    樣品運輸與保存
    樣品運輸:樣品置于1.5mL離心管中,封口膜封好,干冰運輸。
    樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊可用TRIZOL或RNA保護劑處理,液氮凍存后-80℃保存;RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存,避免反復凍融。


    ac4C LncRNA測序(acRIP-seq)
    ac4C LncRNA測序(acRIP-seq)

    ac4C LncRNA測序(acRIP-seq)

    分享到微信

    ×
    云序生物對ac4C RNA乙?;瘷z測手段為acRIP-Seq技術(shù),技術(shù)原理如下: 將乙?;疪NA特異性抗體與被隨機打斷的RNA片段進(jìn)行共孵育,抓取有乙?;揎椀钠芜M(jìn)行測序;同時(shí)需要平行測序一個(gè)對照(Input)樣本,對照樣本只含有打斷的RNA片段,并不添加RNA乙?;禺愋钥贵w與其共孵育。
    021-64878766
    技術(shù)詳情
    技術(shù)簡(jiǎn)介
    ac4C RNA乙?;窃赗NA ac4C修飾酶的作用下,使N4位乙酰胞嘧啶發(fā)生乙?;囊环N保守的化學(xué)修飾(N4-acetylcytidine)。早期研究發(fā)現該修飾存在于真核生物中絲氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上,導致Watson-Crick堿基熱穩定性增加,調控蛋白合成中的編碼準確性;近期研究發(fā)現ac4C分布在人類(lèi)轉錄組中,大多數位點(diǎn)出現在編碼序列(CDS)內,并且通過(guò)改善的mRNA穩定性和翻譯促進(jìn)靶基因表達。目前,ac4C RNA乙?;揎椬鳛橐活?lèi)新型RNA修飾,是繼m6A修飾之后的又一表觀(guān)轉錄組學(xué)熱點(diǎn)和“超級潛力股”!
    云序生物對ac4C RNA乙?;瘷z測手段為acRIP-Seq技術(shù),技術(shù)原理如下: 將乙?;疪NA特異性抗體與被隨機打斷的RNA片段進(jìn)行共孵育,抓取有乙?;揎椀钠芜M(jìn)行測序;同時(shí)需要平行測序一個(gè)對照(Input)樣本,對照樣本只含有打斷的RNA片段,并不添加RNA乙?;禺愋钥贵w與其共孵育。對照樣本用于消除非特異性抓取的乙?;蔚谋尘?。對比免疫共沉淀(IP)樣本和對照樣本(Input)中的序列片段,將RNA乙?;揎椢稽c(diǎn)定位到轉錄組上,并根據RNA-seq數據,計算樣本中RNA乙?;潭燃皩NA表達水平的影響。

    云序優(yōu)勢
    一站式服務(wù)
    客戶(hù)只需提供組織、細胞、體液樣品或RNA,云序生物為您完成從ac4C RNA富集,文庫制備,上機測序到數據分析整套服務(wù)流程。
    抗體富集效率高

    acRIP-seq的富集效率是決定數據質(zhì)量的關(guān)鍵,云序生物acRIP-seq實(shí)驗采用預驗證的商業(yè)化抗體和精心優(yōu)化的實(shí)驗流程,具有極高的效率和特異性。

    分子全覆蓋
    可全 面檢測mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多類(lèi)RNA分子ac4C乙?;稽c(diǎn)。

    嚴格的質(zhì)控
    云序生物對acRIP-seq實(shí)驗每一步驟均設有關(guān)鍵質(zhì)控,全程監控實(shí)驗質(zhì)量,保證客戶(hù)得到優(yōu) 質(zhì)數據。
    專(zhuān)業(yè)的生物信息學(xué)分析
    云序生物擁有專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊,幫助客戶(hù)進(jìn)行實(shí)驗數據的全 面挖掘。
    RNA乙?;?/strong>測序與轉錄組聯(lián)合應用

    可整合RNA乙?;瘮祿娃D錄組數據進(jìn)行生物信息學(xué)關(guān)聯(lián)分析,揭示RNA乙?;瘜虮磉_調控的影響,深入挖掘RNA乙?;墓δ?。 

    案例解析
    案例:mRNA中胞嘧啶核苷乙?;龠M(jìn)其翻譯效率
    原文:Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency 
    期刊:Cell      影響因子:36.22 
    美國ai癥研究所(NCI)和弗雷德里克實(shí)驗室,發(fā)現下調NAT10(RNA乙?;福┠軌蛞?制Hela細胞的行為;并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修飾,下調NAT10后,ac4C的總體水平下降;為了進(jìn)一步探究ac4C的功能,作者對WT和下調NAT10的Hela細胞進(jìn)行acRIP-seq和mRNA測序,發(fā)現ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS區,同時(shí)下調NAT10能夠降低ac4C在mRNA中的定點(diǎn)表達,并與靶mRNA的下調有很大關(guān)系;作者又進(jìn)一步發(fā)現ac4C乙?;揎椖軌蛲ㄟ^(guò)延長(cháng)mRNA的半衰期并促進(jìn)mRNA的穩定性,同時(shí)也能夠通過(guò)ac4C peak中的密碼子偏好性表達,決定并影響mRNA的解碼效率,促進(jìn)底物翻譯。這些發(fā)現不僅擴大了mRNA修飾范圍(包括乙?;瘹埢?,也確立了ac4C在mRNA翻譯調控中的作用。
    ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況

    圖注:ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況


    ac4C延長(cháng)mRNA的半衰期,提高其穩定性

    圖注:ac4C延長(cháng)mRNA的半衰期,提高其穩定性


    ac4C促進(jìn)mRNA的翻譯效率
    圖注:ac4C促進(jìn)mRNA的翻譯效率

    樣品要求
    樣品類(lèi)型
    細胞、組織或RNA,其他樣本類(lèi)型請電詢(xún)。
    樣品量
    a)細胞:≥2×107
    b)組織:500mg - 1g
    c)  RNA:30μg - 300μg 
    d) 超微量滿(mǎn)足500ng - 30μg

    樣品運輸與保存
    樣品運輸:樣品置于1.5mL離心管中,封口膜封好,干冰運輸。
    樣品保存:細胞樣品或新鮮組織塊可用TRIZOL或RNA保護劑處理,液氮凍存后-80℃保存;RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中,-80℃保存,避免反復凍融。


    相關(guān)推薦

    選擇區號

    瀏覽器自帶分享功能也很好用哦~

    ?

    復制成功

    ×
    国产福利男女XX00视频|日本按摩强伦姧在线观看|激情欧美xxbb|国产主播水野梗奈福利|亚洲欧洲日产国码AAA333
    <samp id="2i4cn"></samp>
  • <p id="2i4cn"></p>

    <span id="2i4cn"><input id="2i4cn"></input></span>

    <label id="2i4cn"><code id="2i4cn"></code></label>