技術(shù)簡(jiǎn)介
ac4C RNA乙?；窃赗NA ac4C修飾酶的作用下，使N4位乙酰胞嘧啶發(fā)生乙?；囊环N保守的化學(xué)修飾（N4-acetylcytidine）。早期研究發(fā)現該修飾存在于真核生物中絲氨酸及亮氨酸tRNA和18S rRNA上，導致Watson-Crick堿基熱穩定性增加，調控蛋白合成中的編碼準確性；近期研究發(fā)現ac4C分布在人類(lèi)轉錄組中，大多數位點(diǎn)出現在編碼序列（CDS）內，并且通過(guò)改善的mRNA穩定性和翻譯促進(jìn)靶基因表達。目前，ac4C RNA乙?；揎椬鳛橐活?lèi)新型RNA修飾，是繼m6A修飾之后的又一表觀(guān)轉錄組學(xué)熱點(diǎn)和“超級潛力股”！
云序生物對ac4C RNA乙?；瘷z測手段為acRIP-Seq技術(shù)，技術(shù)原理如下： 將乙?；疪NA特異性抗體與被隨機打斷的RNA片段進(jìn)行共孵育，抓取有乙?；揎椀钠芜M(jìn)行測序；同時(shí)需要平行測序一個(gè)對照（Input）樣本，對照樣本只含有打斷的RNA片段，并不添加RNA乙?；禺愋钥贵w與其共孵育。對照樣本用于消除非特異性抓取的乙?；蔚谋尘?。對比免疫共沉淀（IP）樣本和對照樣本（Input）中的序列片段，將RNA乙?；揎椢稽c(diǎn)定位到轉錄組上，并根據RNA-seq數據，計算樣本中RNA乙?；潭燃皩NA表達水平的影響。

云序優(yōu)勢
一站式服務(wù)
客戶(hù)只需提供組織、細胞、體液樣品或RNA，云序生物為您完成從ac4C RNA富集，文庫制備，上機測序到數據分析整套服務(wù)流程。
抗體富集效率高

acRIP-seq的富集效率是決定數據質(zhì)量的關(guān)鍵，云序生物acRIP-seq實(shí)驗采用預驗證的商業(yè)化抗體和精心優(yōu)化的實(shí)驗流程，具有極高的效率和特異性。

分子全覆蓋
可全 面檢測mRNA、circRNA、LncRNA、pri-miRNA、rRNA、tRNA等多類(lèi)RNA分子ac4C乙?；稽c(diǎn)。

嚴格的質(zhì)控
云序生物對acRIP-seq實(shí)驗每一步驟均設有關(guān)鍵質(zhì)控，全程監控實(shí)驗質(zhì)量，保證客戶(hù)得到優(yōu) 質(zhì)數據。
專(zhuān)業(yè)的生物信息學(xué)分析
云序生物擁有專(zhuān)業(yè)的生物信息分析團隊，幫助客戶(hù)進(jìn)行實(shí)驗數據的全 面挖掘。
RNA乙?；瘻y序與轉錄組聯(lián)合應用

可整合RNA乙?；瘮祿娃D錄組數據進(jìn)行生物信息學(xué)關(guān)聯(lián)分析，揭示RNA乙?；瘜虮磉_調控的影響，深入挖掘RNA乙?；墓δ?。 

案例解析
案例：mRNA中胞嘧啶核苷乙?；龠M(jìn)其翻譯效率
原文：Acetylation of Cytidine in mRNA Promotes Translation Efficiency 
期刊：Cell      影響因子：36.22 
美國ai癥研究所（NCI）和弗雷德里克實(shí)驗室，發(fā)現下調NAT10（RNA乙?；福┠軌蛞?制Hela細胞的行為；并且ac4C是由NTA10催化的mRNA修飾，下調NAT10后，ac4C的總體水平下降；為了進(jìn)一步探究ac4C的功能，作者對WT和下調NAT10的Hela細胞進(jìn)行acRIP-seq和mRNA測序，發(fā)現ac4C 的peak主要富集在mRNA的CDS區，同時(shí)下調NAT10能夠降低ac4C在mRNA中的定點(diǎn)表達，并與靶mRNA的下調有很大關(guān)系；作者又進(jìn)一步發(fā)現ac4C乙?；揎椖軌蛲ㄟ^(guò)延長(cháng)mRNA的半衰期并促進(jìn)mRNA的穩定性，同時(shí)也能夠通過(guò)ac4C peak中的密碼子偏好性表達，決定并影響mRNA的解碼效率，促進(jìn)底物翻譯。這些發(fā)現不僅擴大了mRNA修飾范圍（包括乙?；瘹埢?，也確立了ac4C在mRNA翻譯調控中的作用。

圖注：ac4C的結構及Ac4C peak在mRNA中的特征分布情況

圖注：ac4C延長(cháng)mRNA的半衰期，提高其穩定性

樣品要求
樣品類(lèi)型
細胞、組織或RNA，其他樣本類(lèi)型請電詢(xún)。
樣品量
a）細胞：≥2×10⁷
b）組織：500mg - 1g
c)  RNA：30μg - 300μg 
d) 超微量滿(mǎn)足500ng - 30μg
樣品運輸與保存
樣品運輸：樣品置于1.5mL離心管中，封口膜封好，干冰運輸。
樣品保存：細胞樣品或新鮮組織塊可用TRIZOL或RNA保護劑處理，液氮凍存后-80℃保存；RNA樣品可溶于乙醇或RNA-free的超純水中，-80℃保存，避免反復凍融。